引起睡眠时打呼噜的原因有很多,有全身性的疾病,如肥胖,糖尿病,甲状腺功能低下,肢端肥大症等内分泌系统及神经系统疾病；此病也能由咽部窄小或阻力增高引起,如鼻扁桃体肥大,咽部松弛 , 悬雍垂过长.舌体肥大,舌根部肿瘤,舌后缀 , 颌面部发育畸形,如小颌畸形等.小儿多由于扁桃体肥大及腺样体肥大 .
医学研究证实,打呼噜发生的主要原因为鼻和鼻咽,口咽和软腭及舌根三处发生狭窄,阻塞,再加上睡眠时咽部软自制松弛,舌根后坠等导致气流不能自由通过咽部的气道,振动咽部软组织就会发出一种巨大的鼾声 -- 打呼噜.