做阴道微波两天来姨妈了的话，并不会影响治疗的效果，建议还是要等姨妈走干净了之后再进行治疗是比较好的，像月经的话其实是不受影响的，建议平常的话还是要保持良好的心态，积极配合医生的治疗。