在肛周脓肿首选手术治疗，手术治疗分为切开排脓和根治术两种：1.切开排脓：是二次手术疗法的第一次手术，可排出脓液，迅速减轻症状，一般约需3个月左右，待瘘管形成，内口明确，再行根治术；2.根治术：一次性切开整个脓腔及内口，引流通畅，配合挂线疗法，彻底根治肛周脓肿，是目前治疗肛周脓肿首选手术方式。