治疗腔隙性脑梗塞，现阶段还没有特意治疗的特效药，关键还是在于防治高血压动脉粥样硬化和糖尿病等，纯感觉性卒中主要病理是血管脂肪透明变性，巨噬细胞内充满含铁血黄素，提示红细胞外渗。因此，禁用肝素等抗凝剂，但仍可使用阿司匹林、双嘧达莫；纯运动型较少发生血管脂肪变性，可以应用肝素等抗凝剂、东菱精纯克栓酶及蝮蛇抗栓酶，应警惕出血倾向。腔隙梗死后常有器质性重症抑郁，抗抑郁药物患者常不易耐受，有人推荐选择性5-羟色胺重摄取抑制剂，治疗卒中后重症抑郁安全有效，无明显的不良反应。