巨脑畸形预后不好，至青春期前后因脑部巨大可有面部长度垂直增长，影响牙齿等发育，需牙齿矫形治疗。康复训练和特殊教育应该是针对患儿设计、实施并贯穿于终生的干预措施。患儿最终身高很难预测，但随年龄增长而趋于正常，多数于青春期前后停止异常生长。