脑囊虫治疗方法的选择需根据囊虫部位、囊虫囊泡的大小、多少以及临床表现综合考虑。脑室内囊虫可在内镜下微创手术取出，脑实质内较大的囊虫结节可在立体定向微创手术取出，脑实质内散在的较小的囊虫结节需用杀虫药物治疗。另外，需针对癫痫发作使用抗癫痫药物对症治疗。