您好：这两种疾病都会引起甲状腺功能减退，但原发病因不同。垂体性甲状腺功能减退是由于垂体疾病引起促甲状腺激素（TSH）分泌的减少，从而引起甲状腺素的减少，甲状腺功能减退。所谓甲低功就是指由于甲状腺本身的病变引起甲状腺功能减退，也称为原发性甲状腺功能减退症，而前者称为继发性甲状腺功能减退，两者病变部位不同，病因不同，所以治疗方法也不甚相同。相比来说一般垂体性甲状腺功能减退更复杂一些，两者的治愈都比较困难，一般只能终身替代治疗，当然，若垂体性甲状腺功能减退者治愈垂体疾病后也可恢复正常。